Pinhalzinho, cujo nome derivou das matas de pinheiros que cobriam a região, foi fundado, em 1840, pelas famílias João Domingues Siqueira e Generoso de Godoi Bueno. O povoamento do município deu-se principalmente por imigrantes italianos, entre eles Antônio Fornari e filhos, que fundaram a primeira casa comercial.

O povoado, em 1900, contava com habitações dispersas em números de vinte. A partir de 1910 o crescimento foi acelerado com a criação de escola particular, mantida por moradores como Eduardo Fornari, Henrique Torricelli e outros, e o incremento de população causada pelo anúncio de oferta de terrenos gratuitos, divulgado pelo jornal Cidade de Bragança.

Em 1922, concluiu-se a igreja, obra realizada pelo construtor Tomás de Camargo e o carpinteiro José, sendo trazida diretamente de Barcelona, a imagem da padroeira, Nossa Senhora de Copacabana.

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Distrito criado com a denominação de Pinhal, pela Lei n.º 2.784, de 23-12-1936, subordinado ao município de Bragança.

Pelo Decreto-lei Estadual n.º 9.775, de 30-11-1938, o distrito de Pinhal ou a denominar-se Pinhalzinho.

No quadro fixado para vigorar no período de 1939-1943, o distrito de Pinhalzinho figura no município de Bragança.

Pelo Decreto-lei Estadual n.º 14.334, de 30-11-1944, o município de Bragança ou a denominar-se Bragança Paulista.

Em divisão territorial datada de 1-VII-1950, o distrito de Pinhalzinho (ex-Pinhal) figura no município de Bragança Paulista (ex-Bragança).

Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1-VII-1960.

Elevado à categoria de município com a denominação de Pinhalzinho, pela Lei Estadual n.º 8.092, de 28-02-1964, desmembrado de Bragança Paulista. Sede no antigo distrito de Pinhalzinho. Constituído do distrito sede. Instalado em 28-03-1965.

Em divisão territorial datada de 1-I-1979, o município é constituído do distrito sede.

Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2014.